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形态/ DNA条形码

形态和DNA条形码是唯一的项目,使使用相同的序列数据。因此,推论可以制成关于通过收集和序列的系统发育分析这两个目标。

形态

为褐藻的分类是非常没有解决,有太多的问候形态事件进行研究。了解褐藻的进化史将帮助我们更好地分类藻类,了解藻类海洋盆地之间的运动,从单细胞到多细胞的转变,流动制度对发展的影响。在形态事件的研究往往需要不止一个基因区域,以便能够做出关于物种事件的推论。

DNA条形码

DNA条码技术已经在红,绿,有些褐藻研究成功应用。的DNA条形码是短基因区域,一旦测序,给出了明确的物种的身份。选择认同的分子,而不是形态变异避免问题误认品种因表型可塑性很高。有效的DNA条形码是关于一个700个碱基对和聚焦或部分基因区域。

Brian analyzes a gel.赤子爱胜梓

海带森林是在世界各地的温带潮线下社区非常生产力的生态系统。过去的研究表明,水流和所述浅层和深层潮下区可塑造藻类形态之间的流体动压力的差异。 赤子爱胜梓 是海带物种与在浅潮下人群和邻近卡塔利娜岛,加利福尼亚州,每个与不同的形态深潮下区的例子。是否形态分化由可塑性或遗传差异引起的仍不清楚。这项研究的目的是确定这些人是否仍然适用于两种不同的环境,一个物种或具有足够多样化,被认为是两个不同的物种。样本来自这两个群体潮下收集并从所有样品中提取的DNA。基于在从总基因组DNA提取的多糖含量的差异;这两个群体之间的差异是明显的。 2个基因区域,一个核(5’ LSU的端[Z片段]和线粒体(COX 1 5’ )进行扩增和测序。系统发育分析的LSUŽ片段和 COX 1 5’ 基因区域表明遗传变异的显著量。既表明希望作为DNA条码/标记在浅或深的人群个体之间进行区分。进一步测序和两个群体都基因区域的系统发育分析将与令人振奋的结果按照执行。

DNA条形码在 马尾

马尾 最重要生态价值和广泛的褐藻属之一。属常用既形成上层浮床或大看台沿海热带世界各地的亚热带海洋盆地。然而,仍有许多有待发现有关其进化历史和系统发育,但进展是由无法确定100%准确的物种阻碍。与识别问题是由于表型可塑性和亲缘种的高利率,以及缺乏对加勒比研究 马尾 种类。这是巴拿马的沿海地区,其中多样性的估计高了许多潜在的未被发现的品种更是如此。一个DNA条形码的发展 马尾 将解决基于对系统发育分析的形态和供应数据的传统识别问题。该项目的目标是到三个基因区域条形编码工具比较,并利用这些数据来促成的分辨率 马尾的发展史。获得来自加勒比海和周边地区的巴拿马太平洋21样本。使用改良CTAB法提取样品并利用genomiphi方法来归档DNA的全基因组扩增。选择几个基因区,扩增(例如LSU, RBC升和其-2)中并测序。所有的21个样品中成功提取和全基因组扩增的产品被存档以备将来使用。主比对个体基因区被建造用于使用新的和GenBank数据的属。系统发育分析产生的最大似然的自举树表现出LSU片段z不具有作为条形码足够变化,以功能。这项研究的未来发展方向将集中在LSU配对Z,使用另一LSU片段或其他基因区域。 

ascoseira

ascoseria 海藻是一个独特的物种是特有的南极的恶劣条件。顺序ascosierales,像其他褐藻订单,拥有一支悬而未决分类。 ascoseira杆菌 表现出与动荡和安静的流态区域之间不同的形态。在菌柄长度差异是否由于可塑性的或自适应的进化变化是不明的。样品由三个独立的区域收集,总基因组DNA提取和区域的扩增其-2和 RBCL时进行。序列进行比对,并进行了系统发生分析。没有足够的变化是在基因区域发现,以确定是否有两个群体之间发生了形态。未来的研究将专注于其他几个基因区域以及radtag分析。